Кафедра химии природных соединений была создана в 1946 году по инициативе доктора химических наук О.Садикова. В 1956 году для более широкого изучения флоры при кафедре была создана научная лаборатория проблем химии природных соединений.
    В 1946-1972 годах кафедру занимал акад. Обид Содикович Содиков; В 1972-1980 гг. — проф. О.С. Отрошенко; В 1981-1985 и 1988-1992 годах — проф. Х. Асланов; В 1985-1988 гг. — доц. Т.К. Юнусов; В 1992-1998 годах — проф. С. А. Ауэльбеков; В 1998-2004 гг. — акад. Ш.И. Салихов; В 2004-2005 гг. — проф. А.О. Содиков; В 2005-2012 гг. – проф. Д. Н. Далимов; В 2012-2013 гг. – доц. Хаитбоев А.К. доц. в 2013-2019 гг. Им руководил Маульянов С.А., с 2019 года по настоящее время им руководит проф. Бобоев Б.Н.
    В настоящее время на кафедре преподается 10 предметов по направлениям 5140500-Химия (бакалавриат) и 5141800-Химия природных физиологически активных соединений, а также 8 предметов по специальностям магистратуры 5А140501-Химия (Биоорганическая химия), 5А140502-Радиохимия. проф. Бобоев Б.Н., проф. Далимова Г.Н., доц. Хамидова Г.Р., доц. Маульянов С.А. Проф. Мирзаахмедов Ш.Я., Проф. Эшимбетов А.Г., а также сотрудники Института факультета искусств Республики Узбекистан, проф. Также активно работают Ходжаев С., Юлдашев Х., к.м.н. Ёрматов Б., Бердиев Н. и молодые преподаватели к.м.н. Эшбеков А., докторанты Сарабеков А., Мустафаева Д., магистры Байханова Н., Сиддикова С. также активно работают.
    На кафедрах кафедры изданы монография «Химия, биология и физиологические свойства растений рода Lagochilus» и ряд методических пособий для довузовского образования, издан учебник «Введение в химию углеводов и липидов». разрешение на печать. К новому учебному году будут созданы учебник «Биоорганическая химия» и «Методика преподавания химии». Студентам бакалавриата и магистратуры предоставляются учебные пособия нового поколения.
    Научное направление кафедры посвящено исследованию лекарственных растений, произрастающих в Узбекистане, проводится выделение из них биологически активных соединений, их модификация и изучение их биологической активности. В результате последних научных исследований препарат «Инебрин» одобрен к применению в медицинской практике Фармакологическим комитетом УзР ССС в качестве противоаллергического и кровоостанавливающего средства.
    Учитывая актуальность научного направления кафедры и в связи с 75-летием со дня создания кафедры, 27 мая 2021 года была проведена Республиканская научно-практическая конференция на тему «Развитие и будущее химии». природных соединений в Узбекистане» с участием зарубежных ученых.
    За годы независимости под руководством профессоров и преподавателей кафедры подготовлено 18 кандидатов наук (PhD) и 10 докторов наук (DSc).
    За последние годы на кафедре выполнены следующие научные проекты: ОТ-А-10-2 — Разработка технологии создания и производства противораковых препаратов на основе некоторых алкалоидов (научный руководитель Маульянов С.А.)
ЁА-11-3 — разработка нового эффективного средства с антиоксидантными свойствами на основе местного сырья (научный руководитель Бердиев Н.).
    ЁА-11-4 — Разработка технологии производства кровоостанавливающих коллагеновых пленок на основе местного сырья (научный руководитель Шерибетов С.Г.) ПЗ-2017102419 — Разработка способов получения калийных, магниевых, железных солей пектина (научный руководитель Эшбеков А.Е.) ОТ-Ф7-61 «Новые производные гетероциклических соединений; синтез, строение и биологические свойства» (научный руководитель Бобоев Б.Н.)
    В настоящее время мы работаем над налаживанием сотрудничества с зарубежными организациями, в частности, с Сургутским государственным университетом России, Казахским национальным университетом имени Аль-Фараби, Синьцзянским физико-техническим институтом Китайской Народной Республики, где работают несколько выпускников нашей В настоящее время кафедра обучается на степень магистра, а Шанхайский институт материалов и медицины налаживает связи с учреждениями.