Кафедра была основана в 1940 году профессором М.Е. Массоном (1940–1967).
Кафедру возглавляли:
- проф. Г.Б. Лунина (1967–1981),
- доц. З.И. Усманова (1981–1992),
- проф. А.С. Сагдуллаев (1992–1998),
- проф. Р.Г. Сулейманов (1998–2006, 2009–2014),
- доц. Т.У. Салимовлар (2007–2009).
В настоящее время заведующим кафедрой является профессор Ф.Б. Очилдиев (с 2014 года).
В период работы кафедры также работали профессор М.Е. Массон, академ. Г.А. Пугаченкова, г.ф.д. Н.Г. Там работали Маллицкий, доктор медицинских наук Л.В. Ошанин, доктор медицинских наук А.А. Семёнов, И.И. Петрушевский, С.Н. Замятинин, профессор В.П. Смирнов, Е.В. Давидович, Б.А. Литвинский, Е.В. Ртвеладзе, В.М. Массон, В.И. Сарианиди, Ю.Ф. Буряков, О.Б. Обельченко, Б.Д. Кочнев, Н.И. Крашенникова, З.И. Усманова, Г.Я. Дресвянская и другие известные ученые. Они входят в число самых влиятельных ученых не только в Узбекистане, но и во всем мире.
М.Е. Массон — академик Академии наук Туркменистана (1944 г.р.) и заслуженный ученый Туркменской ССР. Он организовал в рамках кафедры экспедицию по археологическому комплексу Южного Туркестана, экспедицию по археологическому комплексу Термеза и археолого-топографическую экспедицию в Кеш.
В результате работы М. Е. Массона на кафедре была основана Центральноазиатская археологическая школа. Среди выпускников кафедры большой вклад в восстановление археологии и истории Центральной Азии внесли академики, кандидаты наук — Ю. Ф. Буряков, Е. В. Ртвеладзе, А. Сагдуллаев, В. И. Сарианиди; профессора — Б. А. Литвинский, В. М. Массон, Р. Х. Сулейманов. Из них академик А. Сагдуллаев и профессор Р. Х. Сулейманов в настоящее время работают на кафедре.
С. А. Сагдуллаев создал научную школу «Археология и история центральноазиатской государственности». Он обнаружил памятники X-VIII и VII-IV веков до н.э., неизвестные науке центральноазиатской археологии. Он является организатором и научным руководителем масштабных археологических исследований в оазисе Кеш-Шахрисабз с целью подтверждения 2700-летия города Шахрисабз. За свои заслуги он был награжден орденом «Мехнат Шухрати» указом от 27 августа 2020 года.
Р.Х. Сулеймонов первым ввел в археологию метод математического статистического анализа. Этот метод широко используется при изучении других палеолитических поселений Центральной Азии. Под его руководством было установлено, что города Нахшаб (Карши) имеют историю не менее 2700 лет, и юбилеи этого города широко отмечались. Р.Х. Сулейманов был награжден премией «Беруний», орденом «Дружба народов» и медалью «Бобур». Он является заслуженным ученым Узбекистана.
Кафедра археологии и этнологии предлагает:
- «Археология»,
- «Антропология и этнология»
Программы бакалавриата:
- «Археология»,
- «Этногенез (этническая история узбекского народа)»
Программы магистратуры находятся в стадии подготовки.